O Grêmio Náutico União, ao longo da construção de sua história, preocupou-se com a guarda de testemunhos dessa construção. É o que atestam os documentos que compõe o acervo do Museu do União. A organização científica do acervo histórico iniciou oficialmente em 1996. As grandes enchentes do Guaíba, e o incêndio da Sede Náutica, em 1978 causaram perdas de documentos.

Anualmente, são incorporados materiais como: relatórios, imagens, prêmios e troféus das três sedes e dos resultados obtidos pelos atletas unionistas nas várias modalidades. O museu recebe doações, com o critério de que as peças sejam referentes à história da instituição.